全旗共有种子植物878种，分属345个属79科。种数最多是菊科，其次是禾本科、豆科、蔷薇科等。草场总面积6534万亩，其中可利用面积达5110万亩。芦苇面积为14万亩，蕴藏量为18万吨。名贵药材有黄芪、黄芩、甘草、防风、智因、远志、赤芍、秦艽等几十种，食用植物有百合、黄花等，年产量达20万公斤。天然次生林集中分布于宝格达山地区，面积25万亩，优势树种有白桦，其次有黑桦、山杨，还有较为丰富的山杏林资源。2006年，东乌珠穆沁旗辖5个镇、2个苏木：乌里雅斯太镇、道特淖尔镇、额吉淖尔镇、满都胡宝拉格镇、嘎达布其镇和萨麦苏木、呼热图淖尔苏木。东乌珠穆沁旗地表水源较为丰富，主要分布在东部和南部。最大的内流河是乌拉盖河，发源于宝格达山西南麓，横穿乌拉盖开发区和本旗五个苏木，全长320公里，流域面积11077平方公里。还有舍野河、那林河等大小河流14条，大小湖泊106个，泉眼64个。地表水总量为12000万立方米，人均2270立方米。地下水源量为75987立方米／年，可开采量为14577立方米／年。在矿产资源品种上，该旗的资源是品种多，储量大，品位高，初步探明的主要金属、非金属矿产种类有煤、石油、铜、钨、铝、岩盐、水晶、玛瑙、芒硝、珍珠岩、石灰石等十几种，其中褐煤和长烟煤储量达100亿吨以上，固体碱2328万吨，晶体齿盐102万吨。广阔的天然草场上有经济价值较高的野生动物，沙狙、狐狸、野兔、黄羊、旱獭、狼、大雁、大鸡、沙班鸡等十几种，其中旱獭、黄羊和狼为最多。在宝格达山林区还有野猪、驼鹿、雪兔、松鸡等飞禽走兽。畜牧业是东乌珠穆沁旗的基础产业。三十多年来，尤其是实行“草畜双承包”生产责任后，牲畜头数居全国牧业旗县之首。全旗牲畜优良品种最为驰名的是乌珠穆沁肥尾羊和乌珠穆沁白绒山羊。乌珠穆沁马肉，也是在全国和省区有关部门鉴定中达到了出口肉类标准。畜群中还有从国内外引进的内蒙古细毛羊、北京黑白花牛、三河马等优良品种。